Las modernas insurgencias tienen típicamente cuatro elementos: una pequeña fuerza de guerrilla de carácter público, una fuerza secreta mayor clandestina, una auxiliar, y una organización política de carácter público. Las guerrillas están organizadas, entrenadas y equipadas para conducir operaciones cinéticas mientras que las últimas inician el reclutamiento, el entrenamiento, la infiltración, el establecimiento de redes de escape y evasión, captación de fondos, establecimiento de refugios y desarrollo de apoyo exterior. Las Operaciones de Inteligencia Contrainsurgencia frente a guerrillas y fuerzas clandestinas plantean diferentes exigencias en cuanto a requerimientos de inteligencia así como de procesado de información, análisis y diseminación. Las fuerzas clandestinas consisten en pequeñas unidades compartimentadas frecuentemente desconocidas para la mayor parte de la sociedad en la que operan y sus operativos ocultan de forma activa líneas de comunicación, refugios y redes de apoyo logístico. Este artículo analizará las operaciones de inteligencia y contrainteligencia de fuerzas clandestinas, desde las perspectivas estructural y funcional, así como social y comportamental y tratará los desafíos que éstas presentan al apoyo de inteligencia en operaciones.